Tudo o que Satanás precisa para escravizar as almas de toda a humanidade é a Espada Sagrada que é mantida pelo Mestre William e seu filho Falcon. Os Thunder Ninja Kids lutam contra Satanás e seus carniçais com a ajuda do novo mestre de Falcon, Samson, e querem vingar o assassinato do Mestre William, derrotarem Satanás e salvarem a humanidade.